ЕЖЕНЕДЕЛЬНЫЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ БЮЛЛЕТЕНЬ ПО ГРИППУ И ОРВИ
за 22 неделю 2020 года.(25.05.20 - 31.05.20)
Ситуация в России
Резюме
На 22 неделе 2020 г. уровень заболеваемости населения ОРВИ и гриппом в целом по стране немного повысился, по сравнению с предыдущей неделей и, составив 21.3 на 10 000 населения, был ниже базовой линии (72.4) на 70.6% и ниже еженедельного эпидемического порога на 47.8%.
Лабораторными методами на 22 неделе при исследовании материалов от 1308 больных гриппом и ОРВИ в 37 городах зарегистрирован 1 (0.08%) случай гриппа В в 1 городе.
На 22 неделе из 87 исследованных образцов в клеточной культуре МDCK вирусы гриппа не выделены. Всего с начала сезона выделено 1422 вируса гриппа, в том числе 505 вирусов А(H1N1)pdm09, 253 вируса A(H3N2) и 564 вируса гриппа типа В.
Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ в Москве и Санкт-Петербурге антигенно охарактеризовано 797 вирусов гриппа, в том числе 346 вирусов A(H1N1)pdm09, 118 вирусов A(H3N2) и 333 вируса гриппа типа В, выделенных в разных городах страны. Все штаммы A(H1N1)pdm09 антигенно подобны современному вакцинному штамму A/Brisbane/02/2018, за исключением 14 вирусов гриппа A(Н1N1)pdm09, взаимодействующих с антисывороткой к вакцинному штамму в сниженных титрах; 95 вирусов гриппа A(H3N2) были подобны референс-штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, 4 штамма - его дрейф варианты, 4 вируса близкородственны современному вакцинному штамму А/Канзас/14/2017. 330 вирусов гриппа В принадлежали Викторианской линии, 39 из них были антигенно близкородственны вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 41 штамм оказался его дрейф-вариантом, 226 вирусов были подобны вакцинному штамму В/Вашингтон/02/2019, 24 штамма определены как его дрейф-варианты. 3 вируса гриппа типа В были отнесены к линии Ямагата и подобны референс штамму В/Пхукет/3073/2013.
Генетический анализ. В Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) отсеквенировано 442 вируса гриппа. По данным филогенетического анализа 244 вируса гриппа A(H1N1)pdm09 были отнесены к генетической подгруппе 6B.1A5 (референс-штамм A/Норвегия/3433/2018), 1 вирус – к генетической подгруппе 6B.1A7 (референс-штамм А/Словения/1489/2019). 21 вирус гриппа подтипа A(H3N2) отнесен к генетической подгруппе 3С.2a1b + Т131К (референс-штамм A/Южная Австралия/34/2019), 13 вирусов – к генетической подгруппе 3С.2а1b + T135K-B (референс-штамм A/Гонконг/2675/2019). Только один вирус A(H3N2) был подобен штамму A/Канзас/14/2017, введенному в состав вакцин на текущий сезон (клайд 3С.3а). Абсолютное большинство из 161 секвенированных вирусов гриппа типа В относилось к клайду 1А (del162-164) Викторианской линии (референс-вирус В/Вашингтон/02/2019). Один вирус гриппа В относился к клайду 3 Ямагатской линии (референс-штамм B/Пхукет/3073/2013).
Чувствительность к химиопрепаратам: Проведено изучение чувствительности 455 вирусов гриппа, в том числе 173 вирусов A(H1N1)pdm09, 82 вирусов А(H3N2) и 200 вирусов гриппа типа В, к ингибиторам нейраминидазы (озельтамивир, занамивир). Все изученные вирусы были чувствительны к нейраминидазным ингибиторам, за исключением одного штамма вируса гриппа типа В, имеющего сниженную чувствительность к занамивиру.
COVID-2019. По данным на 03.06.2020 на территории РФ зарегистрировано 432 277 случаев COVID-2019 инфекции. Кроме того, согласно поступившей информации на 22 неделе, в системе надзора за гриппом и ОРВИ, по результатам ПЦР анализа клинических образцов от 7079 пациентов в городах - опорных базах НЦГ, коронавирус SARS-CoV-2 обнаружен в 963 (13.6%) случаях.
ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 5.3%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 19.8%.
В системе Сигнального надзора в 7 городах выявлено 259 больных ТОРИ, обследовано 25 больных ТОРИ, случаев гриппа не зарегистрировано. На новую коронавирусную инфекцию обследовано 19 больных ТОРИ в двух городах (Владивосток, Санкт-Петербург), из них новый коронавирус SARS-CoV-2 был выявлен в 10 (52.6%) случаях, в том числе во Владивостоке (6) у больных возрастных групп 30-64 года (5) и 65 лет и старше (1) и в Санкт-Петербурге (4) у больных возрастных групп 5-14 лет (2), 15-29 лет (1) и 30-64 года (1). Один (5.3%) случай ТОРИ из 19 обследованных на ОРВИ был обусловлен респираторно-синцитиальной инфекцией.
При обследовании 31 амбулаторного больного ГПЗ/ОРИ грипп не диагностирован. Случаев заболеваний негриппозной этиологии не зарегистрировано. На новую коронавирусную инфекцию обследовано 37 больных ГПЗ/ОРИ, новый коронавирус SARS-CoV-2 не выявлен.
Эпидемиологические данные
На 22 неделе 2020 г. эпидемические пороги заболеваемости гриппом и ОРВИ не были превышены на 20% и более ни в одном из 61 города.
Лабораторными методами грипп выявлен в 1 городе из 37, приславших данные (см. карту).
На 22 неделе 2020 г. уровень заболеваемости населения ОРВИ и гриппом в целом по стране немного повысился, по сравнению с предыдущей неделей и, составив 21.3 на 10 000 населения, был ниже базовой линии (72.4) на 70.6% и ниже еженедельного эпидемического порога на 47.8%.
На 22 неделе 2020 г. частота клинически диагностированного гриппа (0.0002 на 10 000 населения) оставалась значительно ниже предэпидемической базовой линии (0.061).
На 22 неделе 2020 г. частота госпитализации с диагнозом "грипп" (0.0002 на 10 000 населения) была значительно ниже предэпидемической базовой линии (0.046).
Результаты лабораторной диагностики
Лабораторными методами на 22 неделе при исследовании материалов от 1308 больных гриппом и ОРВИ в 37 городах зарегистрирован 1 (0.08%) случай гриппа В в 1 городе.
На 22 неделе из 87 исследованных образцов в клеточной культуре МDCK вирусы гриппа не выделены. Всего с начала сезона выделено 1422 вируса гриппа, в том числе 505 вирусов А(H1N1)pdm09, 253 вируса A(H3N2) и 564 вируса гриппа типа В.
Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ в Москве и Санкт-Петербурге антигенно охарактеризовано 797 вирусов гриппа, в том числе 346 вирусов A(H1N1)pdm09, 118 вирусов A(H3N2) и 333 вируса гриппа типа В, выделенных в разных городах страны. Все штаммы A(H1N1)pdm09 антигенно подобны современному вакцинному штамму A/Brisbane/02/2018, за исключением 14 вирусов гриппа A(Н1N1)pdm09, взаимодействующих с антисывороткой к вакцинному штамму в сниженных титрах; 95 вирусов гриппа A(H3N2) были подобны референс-штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, 4 штамма - его дрейф варианты, 4 вируса близкородственны современному вакцинному штамму А/Канзас/14/2017. 330 вирусов гриппа В принадлежали Викторианской линии, 39 из них были антигенно близкородственны вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 41 штамм оказался его дрейф-вариантом, 226 вирусов были подобны вакцинному штамму В/Вашингтон/02/2019, 24 штамма определены как его дрейф-варианты. 3 вируса гриппа типа В были отнесены к линии Ямагата и подобны референс штамму В/Пхукет/3073/2013.
Генетический анализ. В Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) отсеквенировано 442 вируса гриппа. По данным филогенетического анализа 244 вируса гриппа A(H1N1)pdm09 были отнесены к генетической подгруппе 6B.1A5 (референс-штамм A/Норвегия/3433/2018), 1 вирус – к генетической подгруппе 6B.1A7 (референс-штамм А/Словения/1489/2019). 21 вирус гриппа подтипа A(H3N2) отнесен к генетической подгруппе 3С.2a1b + Т131К (референс-штамм A/Южная Австралия/34/2019), 13 вирусов – к генетической подгруппе 3С.2а1b + T135K-B (референс-штамм A/Гонконг/2675/2019). Только один вирус A(H3N2) был подобен штамму A/Канзас/14/2017, введенному в состав вакцин на текущий сезон (клайд 3С.3а). Абсолютное большинство из 161 секвенированных вирусов гриппа типа В относилось к клайду 1А (del162-164) Викторианской линии (референс-вирус В/Вашингтон/02/2019). Один вирус гриппа В относился к клайду 3 Ямагатской линии (референс-штамм B/Пхукет/3073/2013).
Чувствительность к химиопрепаратам: Проведено изучение чувствительности 455 вирусов гриппа, в том числе 173 вирусов A(H1N1)pdm09, 82 вирусов А(H3N2) и 200 вирусов гриппа типа В, к ингибиторам нейраминидазы (озельтамивир, занамивир). Все изученные вирусы были чувствительны к нейраминидазным ингибиторам, за исключением одного штамма вируса гриппа типа В, имеющего сниженную чувствительность к занамивиру.
ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 5.3%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 19.8%.
Таблица 1. Результаты ПЦР диагностики в базовых лабораториях двух НЦГ ВОЗ в РФ за 22 неделю 2020г.
Число образцов / число положительных | % положит. | |
Грипп | ||
Число образцов тестированных на грипп | 1308 | - |
Грипп А (не субт.) | 0 | 0,0% |
Грипп A(H1)pdm09 | 0 | 0,0% |
Грипп A(H3) | 0 | 0,0% |
Грипп B | 1 | 0,08% |
Весь грипп | 1 | 0,08% |
Другие ОРВИ | ||
Число образцов тестированных на другие ОРВИ | 798 | - |
Парагрипп | 16 | 2,0% |
Аденовирус | 8 | 1,0% |
РС-вирус | 6 | 0,8% |
Риновирус | 8 | 1,0% |
Коронавирус | 2 | 0,3% |
Метапневмовирус | 1 | 0,1% |
Бокавирус | 1 | 0,1% |
Все ОРВИ | 42 | 5,3% |
SARS-CoV-2 (COVID-19) | ||
Число образцов тестированных на SARS-CoV-2 | 7079 | - |
SARS-CoV-2 | 963 | 13,6% |
COVID-2019. По данным на 03.06.2020 на территории РФ зарегистрировано 432 277 случаев COVID-2019 инфекции. Кроме того, согласно поступившей информации на 22 неделе, в системе надзора за гриппом и ОРВИ, по результатам ПЦР анализа клинических образцов от 7079 пациентов в городах - опорных базах НЦГ, коронавирус SARS-CoV-2 обнаружен в 963 (13.6%) случаях.
Таблица 2. Результаты выделения вирусов гриппа в базовых лабораториях двух НЦГ ВОЗ в РФ за 22 неделю 2020г.
Число образцов / число вирусов | % выделен.вирусов | |
Число образцов | 87 | - |
Грипп A(H1)pdm09 | 0 | 0,0% |
Грипп A(H3) | 0 | 0,0% |
Грипп B | 0 | 0,0% |
Весь грипп | 0 | 0,0% |
Сигнальный надзор
В системе Сигнального надзора в 7 городах выявлено 259 больных ТОРИ, обследовано 25 больных ТОРИ, случаев гриппа не зарегистрировано. На новую коронавирусную инфекцию обследовано 19 больных ТОРИ в двух городах (Владивосток, Санкт-Петербург), из них новый коронавирус SARS-CoV-2 был выявлен в 10 (52.6%) случаях, в том числе во Владивостоке (6) у больных возрастных групп 30-64 года (5) и 65 лет и старше (1) и в Санкт-Петербурге (4) у больных возрастных групп 5-14 лет (2), 15-29 лет (1) и 30-64 года (1). Один (5.3%) случай ТОРИ из 19 обследованных на ОРВИ был обусловлен респираторно-синцитиальной инфекцией.
При обследовании 31 амбулаторного больного ГПЗ/ОРИ грипп не диагностирован. Случаев заболеваний негриппозной этиологии не зарегистрировано. На новую коронавирусную инфекцию обследовано 37 больных ГПЗ/ОРИ, новый коронавирус SARS-CoV-2 не выявлен.
Примечание: Сводка по ситуации в России составлена на основе данных 51 опорной базы ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России и 10 опорных баз ФГБУ «НИЦЭМ им.Н.Ф.Гамалеи» Минздрава России
Ситуация в зарубежных странах
Информация по гриппу за период 27.04-10.05.2020 была опубликована на сайте WHO (Update от 25.05.2020 368), за период 18.05-24.05.2020 - на сайте FluNet, за период 17.05-23.05.2020 - на сайтах США (FluView) и Канады (FluWatch).
По данным FluNet в 62 странах мира было лабораторно подтверждено 149 случаев гриппа, из них 59.1% составил грипп А и 40.9% - грипп В. При субтипировании вирусов гриппа А в 73.7% случаев были выявлены вирусы гриппа A(H1N1)pdm09, в 26.3% - вирусы гриппа А(H3N2). Изученный 1 вирус гриппа В был отнесен к линии Ямагата.
По данным ВОЗ от 02.06.2020 с 31.12.2019 г. в мире ВОЗ официально подтверждено 6 194 533 случая новой коронавирусной инфекции (COVID-19) у людей, в том числе 376 320 (6.1% от числа заболевших) случаев со смертельным исходом. Наибольшее число заболевших зарегистрировано в Европейском регионе - 2 175 941 случай, в том числе 182 416 (8.4% от числа заболевших) случаев с летальным исходом.
Северное полушарие.
Европа. В связи с окончанием сезона выпуск еженедельных бюллетений Flu News Europe окончен. Первый межсезонный бюллетень будет опубликован 26.06.2020г.
США. По данным СDС активность вирусов гриппа была низкой. Частота регистрируемых ГПЗ (1.0%) была ниже базовой линии (2.4%). В Висконсине была зарегистрирована высокая активность ГПЗ, в Пуэрто-Рико и Луизиане - низкая. Лабораториями служб здравоохранения грипп не выявлен. Уровень смертности от пневмонии и гриппа (6.6%) был выше эпидемического порога (6.4%). Зарегистрированы 3 случая смерти детей, связанные с гриппом, в том числе с гриппом A(H1N1)pdm09 - 2 случая на 6 и 11 неделе и с гриппом В - один случай на 17 неделе. Всего за сезон 2019-2020 зарегистрированы 179 случаев смерти детей, связанных с гриппом.
Канада. По данным FluWatch активность вирусов гриппа была низкой. Лабораторными методами за неделю диагностировано 10 (0.1% от числа обследованных) случаев гриппа, в том числе 1 случай гриппа типа А, 2 - A(H1N1)pdm09 и 8 случаев гриппа типа В. Следующий межсезонный бюллетень FluWatch будет опубликован 19.06.2020г.
Азия. В Китае зарегистрированы спорадические случаи гриппоподобных заболеваний.
Африка. В Мозамбике зарегистрирована локальная активность ГПЗ.